Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VhlP40338 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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