Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gjb1P28230 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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