Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Psmb9P28076 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms