Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PdgfraP26618 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms