Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lmo2P25801 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms