Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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