Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
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Myo5bP21271 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Myo5bP21271 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Myo5bP21271 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms