Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
NelfeP19426 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms