Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P18525 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P18525 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P18525 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18525 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms