Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DmdP11531 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
DmdP11531 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DmdP11531 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms