Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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