Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lnx1O70263 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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