Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clk2O35491 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Clk2O35491 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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