Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm5225J3QPL3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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