Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm5294J3QP53 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm5294J3QP53 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm5294J3QP53 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm5294J3QP53 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Gm5294J3QP53 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Gm5294J3QP53 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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