Protein–RNA interactions for Protein: J3QM41

Gm37988, Predicted gene, 37988, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm37988J3QM41 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm37988J3QM41 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm37988J3QM41 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm37988J3QM41 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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