Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Spocd1B1ASB6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Spocd1B1ASB6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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