Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ccdc163A2AGD7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms