Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mbd3Q9Z2D8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms