Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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