Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn8Q9Z260 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn8Q9Z260 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn8Q9Z260 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn8Q9Z260 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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