Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nek3Q9R0A5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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