Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rdh11Q9QYF1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms