Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ap3b2Q9JME5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3b2Q9JME5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms