Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Col5a3Q9JLI2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Col5a3Q9JLI2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Col5a3Q9JLI2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Col5a3Q9JLI2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Col5a3Q9JLI2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Col5a3Q9JLI2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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