Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sv2aQ9JIS5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sv2aQ9JIS5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms