Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxp4Q9DBY0 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms