Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms