Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pfn4Q9D6I3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pfn4Q9D6I3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms