Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Ube2cQ9D1C1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms