Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Zbed3Q9D0L1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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