Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Atxn3Q9CVD2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atxn3Q9CVD2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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