Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms