Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nsmce3Q9CPR8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nsmce3Q9CPR8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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