Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp1b4Q99ME6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms