Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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