Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sf3b3Q921M3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sf3b3Q921M3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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