Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxc12Q8K5B8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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