Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ssh3Q8K330 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms