Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LgsnQ8CIX8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms