Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ercc8Q8CFD5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ercc8Q8CFD5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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