Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms