Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Vash1Q8C1W1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Vash1Q8C1W1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms