Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tmed3Q78IS1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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