Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmeff1Q6PFE7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms