Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg9aQ68FE2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atg9aQ68FE2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg9aQ68FE2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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