Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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