Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BcanQ61361 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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BcanQ61361 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BcanQ61361 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms