Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Cln3Q61124 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cln3Q61124 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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