Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms